Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL8

PDCD10, Programmed cell death protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD10Q9BUL8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCD10Q9BUL8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD10Q9BUL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD10Q9BUL8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD10Q9BUL8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD10Q9BUL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD10Q9BUL8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD10Q9BUL8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD10Q9BUL8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD10Q9BUL8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD10Q9BUL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD10Q9BUL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD10Q9BUL8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD10Q9BUL8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD10Q9BUL8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD10Q9BUL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD10Q9BUL8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD10Q9BUL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms