Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRFN3Q9BTN0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRFN3Q9BTN0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRFN3Q9BTN0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRFN3Q9BTN0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRFN3Q9BTN0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRFN3Q9BTN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRFN3Q9BTN0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRFN3Q9BTN0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRFN3Q9BTN0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRFN3Q9BTN0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRFN3Q9BTN0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LRFN3Q9BTN0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRFN3Q9BTN0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRFN3Q9BTN0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRFN3Q9BTN0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRFN3Q9BTN0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRFN3Q9BTN0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRFN3Q9BTN0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRFN3Q9BTN0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRFN3Q9BTN0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRFN3Q9BTN0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRFN3Q9BTN0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRFN3Q9BTN0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRFN3Q9BTN0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRFN3Q9BTN0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRFN3Q9BTN0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRFN3Q9BTN0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRFN3Q9BTN0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRFN3Q9BTN0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRFN3Q9BTN0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRFN3Q9BTN0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRFN3Q9BTN0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRFN3Q9BTN0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRFN3Q9BTN0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRFN3Q9BTN0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRFN3Q9BTN0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRFN3Q9BTN0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRFN3Q9BTN0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRFN3Q9BTN0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRFN3Q9BTN0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRFN3Q9BTN0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRFN3Q9BTN0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRFN3Q9BTN0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRFN3Q9BTN0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRFN3Q9BTN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LRFN3Q9BTN0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRFN3Q9BTN0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRFN3Q9BTN0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRFN3Q9BTN0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LRFN3Q9BTN0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRFN3Q9BTN0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRFN3Q9BTN0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRFN3Q9BTN0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRFN3Q9BTN0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRFN3Q9BTN0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRFN3Q9BTN0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRFN3Q9BTN0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRFN3Q9BTN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRFN3Q9BTN0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRFN3Q9BTN0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRFN3Q9BTN0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRFN3Q9BTN0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRFN3Q9BTN0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRFN3Q9BTN0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRFN3Q9BTN0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRFN3Q9BTN0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRFN3Q9BTN0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRFN3Q9BTN0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRFN3Q9BTN0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRFN3Q9BTN0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRFN3Q9BTN0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRFN3Q9BTN0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LRFN3Q9BTN0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRFN3Q9BTN0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LRFN3Q9BTN0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LRFN3Q9BTN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRFN3Q9BTN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRFN3Q9BTN0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms