Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYGO2Q9BRQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PYGO2Q9BRQ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGO2Q9BRQ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PYGO2Q9BRQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PYGO2Q9BRQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGO2Q9BRQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PYGO2Q9BRQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGO2Q9BRQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGO2Q9BRQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGO2Q9BRQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYGO2Q9BRQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYGO2Q9BRQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGO2Q9BRQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGO2Q9BRQ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGO2Q9BRQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PYGO2Q9BRQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGO2Q9BRQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGO2Q9BRQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PYGO2Q9BRQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGO2Q9BRQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGO2Q9BRQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGO2Q9BRQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGO2Q9BRQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGO2Q9BRQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PYGO2Q9BRQ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYGO2Q9BRQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PYGO2Q9BRQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PYGO2Q9BRQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PYGO2Q9BRQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms