Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA1CQ9BQE3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBA1CQ9BQE3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBA1CQ9BQE3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBA1CQ9BQE3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA1CQ9BQE3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA1CQ9BQE3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBA1CQ9BQE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBA1CQ9BQE3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBA1CQ9BQE3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA1CQ9BQE3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBA1CQ9BQE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBA1CQ9BQE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA1CQ9BQE3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBA1CQ9BQE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBA1CQ9BQE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA1CQ9BQE3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA1CQ9BQE3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA1CQ9BQE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA1CQ9BQE3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA1CQ9BQE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA1CQ9BQE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBA1CQ9BQE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms