Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLX1AQ9BQ83 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLX1AQ9BQ83 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLX1AQ9BQ83 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLX1AQ9BQ83 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLX1AQ9BQ83 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLX1AQ9BQ83 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLX1AQ9BQ83 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLX1AQ9BQ83 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLX1AQ9BQ83 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLX1AQ9BQ83 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLX1AQ9BQ83 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLX1AQ9BQ83 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLX1AQ9BQ83 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLX1AQ9BQ83 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLX1AQ9BQ83 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLX1AQ9BQ83 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLX1AQ9BQ83 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLX1AQ9BQ83 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLX1AQ9BQ83 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLX1AQ9BQ83 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLX1AQ9BQ83 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLX1AQ9BQ83 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLX1AQ9BQ83 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLX1AQ9BQ83 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLX1AQ9BQ83 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLX1AQ9BQ83 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLX1AQ9BQ83 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX1AQ9BQ83 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLX1AQ9BQ83 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLX1AQ9BQ83 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLX1AQ9BQ83 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLX1AQ9BQ83 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLX1AQ9BQ83 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLX1AQ9BQ83 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLX1AQ9BQ83 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX1AQ9BQ83 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX1AQ9BQ83 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLX1AQ9BQ83 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX1AQ9BQ83 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLX1AQ9BQ83 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX1AQ9BQ83 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLX1AQ9BQ83 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX1AQ9BQ83 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX1AQ9BQ83 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLX1AQ9BQ83 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX1AQ9BQ83 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX1AQ9BQ83 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLX1AQ9BQ83 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms