Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMP4Q99727 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMP4Q99727 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP4Q99727 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMP4Q99727 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMP4Q99727 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMP4Q99727 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP4Q99727 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP4Q99727 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP4Q99727 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP4Q99727 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP4Q99727 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP4Q99727 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP4Q99727 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIMP4Q99727 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIMP4Q99727 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMP4Q99727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMP4Q99727 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIMP4Q99727 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMP4Q99727 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms