Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDNQ99608 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDNQ99608 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDNQ99608 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDNQ99608 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDNQ99608 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDNQ99608 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDNQ99608 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDNQ99608 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDNQ99608 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDNQ99608 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NDNQ99608 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDNQ99608 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDNQ99608 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDNQ99608 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDNQ99608 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDNQ99608 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDNQ99608 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDNQ99608 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDNQ99608 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDNQ99608 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDNQ99608 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDNQ99608 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDNQ99608 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDNQ99608 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDNQ99608 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDNQ99608 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDNQ99608 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDNQ99608 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDNQ99608 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDNQ99608 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDNQ99608 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NDNQ99608 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NDNQ99608 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDNQ99608 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NDNQ99608 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NDNQ99608 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NDNQ99608 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NDNQ99608 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDNQ99608 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDNQ99608 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NDNQ99608 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDNQ99608 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NDNQ99608 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDNQ99608 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDNQ99608 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDNQ99608 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDNQ99608 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDNQ99608 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDNQ99608 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDNQ99608 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDNQ99608 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDNQ99608 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDNQ99608 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDNQ99608 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDNQ99608 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDNQ99608 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDNQ99608 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDNQ99608 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDNQ99608 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDNQ99608 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NDNQ99608 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDNQ99608 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDNQ99608 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDNQ99608 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDNQ99608 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDNQ99608 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDNQ99608 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDNQ99608 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDNQ99608 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDNQ99608 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDNQ99608 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDNQ99608 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDNQ99608 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NDNQ99608 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDNQ99608 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDNQ99608 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDNQ99608 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDNQ99608 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDNQ99608 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDNQ99608 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDNQ99608 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDNQ99608 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDNQ99608 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDNQ99608 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDNQ99608 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDNQ99608 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDNQ99608 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NDNQ99608 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NDNQ99608 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDNQ99608 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDNQ99608 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDNQ99608 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDNQ99608 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDNQ99608 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDNQ99608 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDNQ99608 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NDNQ99608 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDNQ99608 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDNQ99608 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms