Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF2Q99496 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF2Q99496 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF2Q99496 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF2Q99496 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF2Q99496 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF2Q99496 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF2Q99496 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF2Q99496 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF2Q99496 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF2Q99496 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF2Q99496 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF2Q99496 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF2Q99496 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF2Q99496 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF2Q99496 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF2Q99496 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF2Q99496 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF2Q99496 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF2Q99496 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms