Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHOX2BQ99453 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHOX2BQ99453 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHOX2BQ99453 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHOX2BQ99453 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHOX2BQ99453 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHOX2BQ99453 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHOX2BQ99453 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHOX2BQ99453 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHOX2BQ99453 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHOX2BQ99453 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHOX2BQ99453 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PHOX2BQ99453 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHOX2BQ99453 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHOX2BQ99453 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PHOX2BQ99453 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHOX2BQ99453 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHOX2BQ99453 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHOX2BQ99453 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PHOX2BQ99453 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHOX2BQ99453 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHOX2BQ99453 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHOX2BQ99453 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHOX2BQ99453 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHOX2BQ99453 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PHOX2BQ99453 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHOX2BQ99453 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHOX2BQ99453 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHOX2BQ99453 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHOX2BQ99453 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHOX2BQ99453 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHOX2BQ99453 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHOX2BQ99453 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHOX2BQ99453 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHOX2BQ99453 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHOX2BQ99453 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHOX2BQ99453 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PHOX2BQ99453 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHOX2BQ99453 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHOX2BQ99453 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHOX2BQ99453 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHOX2BQ99453 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHOX2BQ99453 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHOX2BQ99453 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHOX2BQ99453 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHOX2BQ99453 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHOX2BQ99453 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PHOX2BQ99453 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHOX2BQ99453 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHOX2BQ99453 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHOX2BQ99453 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHOX2BQ99453 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHOX2BQ99453 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHOX2BQ99453 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHOX2BQ99453 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PHOX2BQ99453 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHOX2BQ99453 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHOX2BQ99453 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHOX2BQ99453 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHOX2BQ99453 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHOX2BQ99453 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHOX2BQ99453 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHOX2BQ99453 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHOX2BQ99453 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHOX2BQ99453 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHOX2BQ99453 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHOX2BQ99453 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHOX2BQ99453 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHOX2BQ99453 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHOX2BQ99453 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHOX2BQ99453 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms