Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SORCS2Q96PQ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SORCS2Q96PQ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SORCS2Q96PQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS2Q96PQ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SORCS2Q96PQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SORCS2Q96PQ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS2Q96PQ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SORCS2Q96PQ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORCS2Q96PQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORCS2Q96PQ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORCS2Q96PQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORCS2Q96PQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORCS2Q96PQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORCS2Q96PQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORCS2Q96PQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORCS2Q96PQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS2Q96PQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORCS2Q96PQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SORCS2Q96PQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SORCS2Q96PQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SORCS2Q96PQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms