Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
ARAP1Q96P48 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
ARAP1Q96P48 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
ARAP1Q96P48 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
ARAP1Q96P48 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
ARAP1Q96P48 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
ARAP1Q96P48 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
ARAP1Q96P48 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
ARAP1Q96P48 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.55■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.53■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ARAP1Q96P48 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
ARAP1Q96P48 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ARAP1Q96P48 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
ARAP1Q96P48 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
ARAP1Q96P48 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
ARAP1Q96P48 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
ARAP1Q96P48 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.37■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
ARAP1Q96P48 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
ARAP1Q96P48 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
ARAP1Q96P48 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
ARAP1Q96P48 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC46.29■■■■■ 5
ARAP1Q96P48 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ARAP1Q96P48 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
ARAP1Q96P48 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
ARAP1Q96P48 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARAP1Q96P48 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARAP1Q96P48 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARAP1Q96P48 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46■■■■■ 4.95
ARAP1Q96P48 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46■■■■■ 4.95
ARAP1Q96P48 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
ARAP1Q96P48 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.95■■■■■ 4.95
ARAP1Q96P48 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ARAP1Q96P48 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
ARAP1Q96P48 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC45.79■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
ARAP1Q96P48 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
ARAP1Q96P48 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ARAP1Q96P48 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
ARAP1Q96P48 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
ARAP1Q96P48 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
ARAP1Q96P48 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ARAP1Q96P48 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
ARAP1Q96P48 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
ARAP1Q96P48 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 878.1 ms