Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FGD4Q96M96 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FGD4Q96M96 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FGD4Q96M96 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FGD4Q96M96 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FGD4Q96M96 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FGD4Q96M96 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FGD4Q96M96 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FGD4Q96M96 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FGD4Q96M96 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FGD4Q96M96 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FGD4Q96M96 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FGD4Q96M96 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FGD4Q96M96 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FGD4Q96M96 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FGD4Q96M96 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FGD4Q96M96 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FGD4Q96M96 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
FGD4Q96M96 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FGD4Q96M96 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FGD4Q96M96 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FGD4Q96M96 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FGD4Q96M96 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
FGD4Q96M96 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD4Q96M96 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD4Q96M96 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD4Q96M96 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD4Q96M96 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD4Q96M96 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD4Q96M96 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD4Q96M96 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FGD4Q96M96 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FGD4Q96M96 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FGD4Q96M96 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FGD4Q96M96 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
FGD4Q96M96 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FGD4Q96M96 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FGD4Q96M96 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FGD4Q96M96 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FGD4Q96M96 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FGD4Q96M96 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
FGD4Q96M96 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
FGD4Q96M96 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FGD4Q96M96 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FGD4Q96M96 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FGD4Q96M96 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FGD4Q96M96 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FGD4Q96M96 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FGD4Q96M96 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
FGD4Q96M96 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
FGD4Q96M96 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FGD4Q96M96 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FGD4Q96M96 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FGD4Q96M96 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FGD4Q96M96 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FGD4Q96M96 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FGD4Q96M96 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FGD4Q96M96 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
FGD4Q96M96 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms