Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRIMPOLQ96LW4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRIMPOLQ96LW4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIMPOLQ96LW4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIMPOLQ96LW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms