Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PRIMPOLQ96LW4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRIMPOLQ96LW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PRIMPOLQ96LW4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PRIMPOLQ96LW4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRIMPOLQ96LW4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRIMPOLQ96LW4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRIMPOLQ96LW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRIMPOLQ96LW4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRIMPOLQ96LW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRIMPOLQ96LW4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIMPOLQ96LW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIMPOLQ96LW4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRIMPOLQ96LW4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRIMPOLQ96LW4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIMPOLQ96LW4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIMPOLQ96LW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRIMPOLQ96LW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms