Protein–RNA interactions for Protein: Q96L73

NSD1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD1Q96L73 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSD1Q96L73 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NSD1Q96L73 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSD1Q96L73 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSD1Q96L73 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSD1Q96L73 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSD1Q96L73 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NSD1Q96L73 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSD1Q96L73 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD1Q96L73 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD1Q96L73 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD1Q96L73 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSD1Q96L73 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSD1Q96L73 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSD1Q96L73 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NSD1Q96L73 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD1Q96L73 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD1Q96L73 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD1Q96L73 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD1Q96L73 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD1Q96L73 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD1Q96L73 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD1Q96L73 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD1Q96L73 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSD1Q96L73 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSD1Q96L73 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSD1Q96L73 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSD1Q96L73 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSD1Q96L73 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD1Q96L73 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms