Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPGRIP1Q96KN7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RPGRIP1Q96KN7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPGRIP1Q96KN7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPGRIP1Q96KN7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPGRIP1Q96KN7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPGRIP1Q96KN7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPGRIP1Q96KN7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPGRIP1Q96KN7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPGRIP1Q96KN7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RPGRIP1Q96KN7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPGRIP1Q96KN7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPGRIP1Q96KN7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPGRIP1Q96KN7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPGRIP1Q96KN7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPGRIP1Q96KN7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPGRIP1Q96KN7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPGRIP1Q96KN7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPGRIP1Q96KN7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPGRIP1Q96KN7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPGRIP1Q96KN7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPGRIP1Q96KN7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPGRIP1Q96KN7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPGRIP1Q96KN7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPGRIP1Q96KN7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPGRIP1Q96KN7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPGRIP1Q96KN7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPGRIP1Q96KN7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPGRIP1Q96KN7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPGRIP1Q96KN7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPGRIP1Q96KN7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPGRIP1Q96KN7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPGRIP1Q96KN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPGRIP1Q96KN7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPGRIP1Q96KN7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPGRIP1Q96KN7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPGRIP1Q96KN7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPGRIP1Q96KN7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RPGRIP1Q96KN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
RPGRIP1Q96KN7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPGRIP1Q96KN7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RPGRIP1Q96KN7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPGRIP1Q96KN7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPGRIP1Q96KN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPGRIP1Q96KN7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms