Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNDP1Q96KN2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNDP1Q96KN2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNDP1Q96KN2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNDP1Q96KN2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNDP1Q96KN2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNDP1Q96KN2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNDP1Q96KN2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNDP1Q96KN2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNDP1Q96KN2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNDP1Q96KN2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNDP1Q96KN2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNDP1Q96KN2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNDP1Q96KN2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNDP1Q96KN2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNDP1Q96KN2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNDP1Q96KN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNDP1Q96KN2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNDP1Q96KN2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNDP1Q96KN2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNDP1Q96KN2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNDP1Q96KN2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNDP1Q96KN2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNDP1Q96KN2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNDP1Q96KN2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CNDP1Q96KN2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNDP1Q96KN2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNDP1Q96KN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNDP1Q96KN2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNDP1Q96KN2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNDP1Q96KN2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNDP1Q96KN2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNDP1Q96KN2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNDP1Q96KN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNDP1Q96KN2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms