Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX4I2Q96KJ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I2Q96KJ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I2Q96KJ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I2Q96KJ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX4I2Q96KJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX4I2Q96KJ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX4I2Q96KJ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX4I2Q96KJ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX4I2Q96KJ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX4I2Q96KJ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COX4I2Q96KJ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COX4I2Q96KJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX4I2Q96KJ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I2Q96KJ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I2Q96KJ9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I2Q96KJ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I2Q96KJ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I2Q96KJ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I2Q96KJ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COX4I2Q96KJ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COX4I2Q96KJ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COX4I2Q96KJ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COX4I2Q96KJ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COX4I2Q96KJ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COX4I2Q96KJ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I2Q96KJ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COX4I2Q96KJ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COX4I2Q96KJ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COX4I2Q96KJ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COX4I2Q96KJ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COX4I2Q96KJ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COX4I2Q96KJ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COX4I2Q96KJ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COX4I2Q96KJ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COX4I2Q96KJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COX4I2Q96KJ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COX4I2Q96KJ9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COX4I2Q96KJ9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms