Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAX2Q96IS3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAX2Q96IS3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAX2Q96IS3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAX2Q96IS3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAX2Q96IS3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAX2Q96IS3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAX2Q96IS3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAX2Q96IS3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAX2Q96IS3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAX2Q96IS3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAX2Q96IS3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAX2Q96IS3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAX2Q96IS3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAX2Q96IS3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAX2Q96IS3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAX2Q96IS3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAX2Q96IS3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAX2Q96IS3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAX2Q96IS3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAX2Q96IS3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAX2Q96IS3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAX2Q96IS3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms