Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDX11Q96FC9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDX11Q96FC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
DDX11Q96FC9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DDX11Q96FC9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDX11Q96FC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDX11Q96FC9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDX11Q96FC9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDX11Q96FC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDX11Q96FC9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX11Q96FC9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDX11Q96FC9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDX11Q96FC9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX11Q96FC9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX11Q96FC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX11Q96FC9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX11Q96FC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX11Q96FC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX11Q96FC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX11Q96FC9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDX11Q96FC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DDX11Q96FC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
DDX11Q96FC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
DDX11Q96FC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDX11Q96FC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDX11Q96FC9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDX11Q96FC9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDX11Q96FC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDX11Q96FC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDX11Q96FC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DDX11Q96FC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms