Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEH1LQ96EE3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEH1LQ96EE3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEH1LQ96EE3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEH1LQ96EE3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEH1LQ96EE3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEH1LQ96EE3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEH1LQ96EE3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEH1LQ96EE3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEH1LQ96EE3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEH1LQ96EE3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEH1LQ96EE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEH1LQ96EE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEH1LQ96EE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEH1LQ96EE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEH1LQ96EE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEH1LQ96EE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEH1LQ96EE3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEH1LQ96EE3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEH1LQ96EE3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEH1LQ96EE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms