Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATG4CQ96DT6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATG4CQ96DT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATG4CQ96DT6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATG4CQ96DT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATG4CQ96DT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ATG4CQ96DT6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ATG4CQ96DT6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ATG4CQ96DT6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATG4CQ96DT6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATG4CQ96DT6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG4CQ96DT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATG4CQ96DT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATG4CQ96DT6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATG4CQ96DT6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATG4CQ96DT6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ATG4CQ96DT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATG4CQ96DT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG4CQ96DT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG4CQ96DT6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATG4CQ96DT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATG4CQ96DT6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATG4CQ96DT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATG4CQ96DT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ATG4CQ96DT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATG4CQ96DT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATG4CQ96DT6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATG4CQ96DT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATG4CQ96DT6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATG4CQ96DT6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATG4CQ96DT6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATG4CQ96DT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATG4CQ96DT6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATG4CQ96DT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATG4CQ96DT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATG4CQ96DT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATG4CQ96DT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ATG4CQ96DT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATG4CQ96DT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATG4CQ96DT6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATG4CQ96DT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATG4CQ96DT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATG4CQ96DT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATG4CQ96DT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATG4CQ96DT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATG4CQ96DT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATG4CQ96DT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATG4CQ96DT6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ATG4CQ96DT6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ATG4CQ96DT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ATG4CQ96DT6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATG4CQ96DT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATG4CQ96DT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATG4CQ96DT6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATG4CQ96DT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATG4CQ96DT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATG4CQ96DT6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ATG4CQ96DT6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms