Protein–RNA interactions for Protein: Q96D42

HAVCR1, Hepatitis A virus cellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR1Q96D42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAVCR1Q96D42 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAVCR1Q96D42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAVCR1Q96D42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAVCR1Q96D42 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAVCR1Q96D42 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HAVCR1Q96D42 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HAVCR1Q96D42 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAVCR1Q96D42 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HAVCR1Q96D42 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HAVCR1Q96D42 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAVCR1Q96D42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HAVCR1Q96D42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HAVCR1Q96D42 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HAVCR1Q96D42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAVCR1Q96D42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAVCR1Q96D42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAVCR1Q96D42 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAVCR1Q96D42 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAVCR1Q96D42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAVCR1Q96D42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAVCR1Q96D42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAVCR1Q96D42 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HAVCR1Q96D42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HAVCR1Q96D42 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HAVCR1Q96D42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAVCR1Q96D42 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAVCR1Q96D42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HAVCR1Q96D42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAVCR1Q96D42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HAVCR1Q96D42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HAVCR1Q96D42 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms