Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L1Q96BA8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L1Q96BA8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L1Q96BA8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L1Q96BA8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3L1Q96BA8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3L1Q96BA8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3L1Q96BA8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3L1Q96BA8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L1Q96BA8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3L1Q96BA8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L1Q96BA8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3L1Q96BA8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREB3L1Q96BA8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREB3L1Q96BA8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms