Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAMF9Q96A28 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF9Q96A28 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLAMF9Q96A28 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLAMF9Q96A28 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLAMF9Q96A28 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF9Q96A28 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLAMF9Q96A28 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLAMF9Q96A28 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLAMF9Q96A28 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLAMF9Q96A28 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLAMF9Q96A28 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLAMF9Q96A28 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLAMF9Q96A28 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLAMF9Q96A28 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF9Q96A28 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLAMF9Q96A28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms