Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP6V1E2Q96A05 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP6V1E2Q96A05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1E2Q96A05 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V1E2Q96A05 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP6V1E2Q96A05 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP6V1E2Q96A05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP6V1E2Q96A05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP6V1E2Q96A05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP6V1E2Q96A05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP6V1E2Q96A05 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP6V1E2Q96A05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP6V1E2Q96A05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP6V1E2Q96A05 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP6V1E2Q96A05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP6V1E2Q96A05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP6V1E2Q96A05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms