Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNPO1Q92973 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNPO1Q92973 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNPO1Q92973 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNPO1Q92973 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNPO1Q92973 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNPO1Q92973 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNPO1Q92973 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNPO1Q92973 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNPO1Q92973 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNPO1Q92973 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNPO1Q92973 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNPO1Q92973 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNPO1Q92973 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TNPO1Q92973 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNPO1Q92973 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNPO1Q92973 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TNPO1Q92973 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNPO1Q92973 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNPO1Q92973 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNPO1Q92973 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNPO1Q92973 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNPO1Q92973 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNPO1Q92973 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNPO1Q92973 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNPO1Q92973 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNPO1Q92973 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNPO1Q92973 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNPO1Q92973 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNPO1Q92973 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNPO1Q92973 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNPO1Q92973 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNPO1Q92973 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNPO1Q92973 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNPO1Q92973 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNPO1Q92973 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms