Protein–RNA interactions for Protein: Q92766

RREB1, Ras-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RREB1Q92766 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RREB1Q92766 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RREB1Q92766 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RREB1Q92766 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RREB1Q92766 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
RREB1Q92766 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
RREB1Q92766 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
RREB1Q92766 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
RREB1Q92766 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RREB1Q92766 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RREB1Q92766 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RREB1Q92766 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RREB1Q92766 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RREB1Q92766 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RREB1Q92766 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RREB1Q92766 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RREB1Q92766 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
RREB1Q92766 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RREB1Q92766 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RREB1Q92766 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RREB1Q92766 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RREB1Q92766 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RREB1Q92766 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RREB1Q92766 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RREB1Q92766 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RREB1Q92766 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RREB1Q92766 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RREB1Q92766 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RREB1Q92766 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RREB1Q92766 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RREB1Q92766 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RREB1Q92766 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RREB1Q92766 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RREB1Q92766 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RREB1Q92766 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RREB1Q92766 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RREB1Q92766 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RREB1Q92766 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RREB1Q92766 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
RREB1Q92766 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RREB1Q92766 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RREB1Q92766 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RREB1Q92766 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RREB1Q92766 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RREB1Q92766 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RREB1Q92766 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RREB1Q92766 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RREB1Q92766 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RREB1Q92766 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RREB1Q92766 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RREB1Q92766 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RREB1Q92766 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RREB1Q92766 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
RREB1Q92766 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RREB1Q92766 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RREB1Q92766 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RREB1Q92766 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RREB1Q92766 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
RREB1Q92766 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
RREB1Q92766 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RREB1Q92766 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RREB1Q92766 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RREB1Q92766 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RREB1Q92766 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RREB1Q92766 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RREB1Q92766 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RREB1Q92766 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
RREB1Q92766 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RREB1Q92766 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RREB1Q92766 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RREB1Q92766 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RREB1Q92766 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RREB1Q92766 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RREB1Q92766 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RREB1Q92766 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RREB1Q92766 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RREB1Q92766 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
RREB1Q92766 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RREB1Q92766 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RREB1Q92766 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RREB1Q92766 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms