Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BAP1Q92560 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BAP1Q92560 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BAP1Q92560 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BAP1Q92560 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BAP1Q92560 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BAP1Q92560 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BAP1Q92560 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BAP1Q92560 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BAP1Q92560 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BAP1Q92560 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BAP1Q92560 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BAP1Q92560 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BAP1Q92560 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BAP1Q92560 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BAP1Q92560 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BAP1Q92560 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BAP1Q92560 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BAP1Q92560 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BAP1Q92560 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BAP1Q92560 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BAP1Q92560 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BAP1Q92560 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BAP1Q92560 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BAP1Q92560 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BAP1Q92560 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BAP1Q92560 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
BAP1Q92560 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BAP1Q92560 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BAP1Q92560 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BAP1Q92560 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BAP1Q92560 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BAP1Q92560 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BAP1Q92560 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BAP1Q92560 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BAP1Q92560 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BAP1Q92560 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BAP1Q92560 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BAP1Q92560 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BAP1Q92560 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BAP1Q92560 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BAP1Q92560 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BAP1Q92560 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BAP1Q92560 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BAP1Q92560 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BAP1Q92560 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BAP1Q92560 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BAP1Q92560 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BAP1Q92560 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BAP1Q92560 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BAP1Q92560 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BAP1Q92560 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms