Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM9SF4Q92544 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM9SF4Q92544 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM9SF4Q92544 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM9SF4Q92544 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM9SF4Q92544 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TM9SF4Q92544 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TM9SF4Q92544 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TM9SF4Q92544 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TM9SF4Q92544 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM9SF4Q92544 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM9SF4Q92544 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM9SF4Q92544 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM9SF4Q92544 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM9SF4Q92544 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TM9SF4Q92544 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM9SF4Q92544 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM9SF4Q92544 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM9SF4Q92544 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TM9SF4Q92544 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM9SF4Q92544 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM9SF4Q92544 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM9SF4Q92544 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM9SF4Q92544 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TM9SF4Q92544 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TM9SF4Q92544 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM9SF4Q92544 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM9SF4Q92544 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM9SF4Q92544 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM9SF4Q92544 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM9SF4Q92544 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms