Protein–RNA interactions for Protein: Q92522

H1FX, Histone H1x, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FXQ92522 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H1FXQ92522 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H1FXQ92522 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H1FXQ92522 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H1FXQ92522 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H1FXQ92522 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H1FXQ92522 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H1FXQ92522 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H1FXQ92522 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H1FXQ92522 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H1FXQ92522 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H1FXQ92522 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H1FXQ92522 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H1FXQ92522 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H1FXQ92522 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H1FXQ92522 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H1FXQ92522 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1FXQ92522 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1FXQ92522 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H1FXQ92522 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H1FXQ92522 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1FXQ92522 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H1FXQ92522 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms