Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF8

DEDD2, DNA-binding death effector domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEDD2Q8WXF8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DEDD2Q8WXF8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEDD2Q8WXF8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEDD2Q8WXF8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEDD2Q8WXF8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEDD2Q8WXF8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DEDD2Q8WXF8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEDD2Q8WXF8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEDD2Q8WXF8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEDD2Q8WXF8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEDD2Q8WXF8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEDD2Q8WXF8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEDD2Q8WXF8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEDD2Q8WXF8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEDD2Q8WXF8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEDD2Q8WXF8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEDD2Q8WXF8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEDD2Q8WXF8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEDD2Q8WXF8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEDD2Q8WXF8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEDD2Q8WXF8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEDD2Q8WXF8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEDD2Q8WXF8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEDD2Q8WXF8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEDD2Q8WXF8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEDD2Q8WXF8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEDD2Q8WXF8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEDD2Q8WXF8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms