Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CASKIN1Q8WXD9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
CASKIN1Q8WXD9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
CASKIN1Q8WXD9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CASKIN1Q8WXD9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CASKIN1Q8WXD9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
CASKIN1Q8WXD9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
CASKIN1Q8WXD9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CASKIN1Q8WXD9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CASKIN1Q8WXD9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
CASKIN1Q8WXD9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CASKIN1Q8WXD9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CASKIN1Q8WXD9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
CASKIN1Q8WXD9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
CASKIN1Q8WXD9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CASKIN1Q8WXD9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CASKIN1Q8WXD9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CASKIN1Q8WXD9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CASKIN1Q8WXD9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CASKIN1Q8WXD9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CASKIN1Q8WXD9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CASKIN1Q8WXD9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CASKIN1Q8WXD9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CASKIN1Q8WXD9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CASKIN1Q8WXD9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
CASKIN1Q8WXD9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CASKIN1Q8WXD9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
CASKIN1Q8WXD9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CASKIN1Q8WXD9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CASKIN1Q8WXD9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CASKIN1Q8WXD9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
CASKIN1Q8WXD9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CASKIN1Q8WXD9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CASKIN1Q8WXD9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CASKIN1Q8WXD9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
CASKIN1Q8WXD9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CASKIN1Q8WXD9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CASKIN1Q8WXD9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CASKIN1Q8WXD9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
CASKIN1Q8WXD9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CASKIN1Q8WXD9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CASKIN1Q8WXD9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
CASKIN1Q8WXD9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CASKIN1Q8WXD9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CASKIN1Q8WXD9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CASKIN1Q8WXD9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CASKIN1Q8WXD9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CASKIN1Q8WXD9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CASKIN1Q8WXD9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CASKIN1Q8WXD9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CASKIN1Q8WXD9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CASKIN1Q8WXD9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CASKIN1Q8WXD9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CASKIN1Q8WXD9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
CASKIN1Q8WXD9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CASKIN1Q8WXD9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CASKIN1Q8WXD9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CASKIN1Q8WXD9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CASKIN1Q8WXD9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
CASKIN1Q8WXD9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CASKIN1Q8WXD9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CASKIN1Q8WXD9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CASKIN1Q8WXD9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
CASKIN1Q8WXD9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
CASKIN1Q8WXD9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
CASKIN1Q8WXD9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.38■■■■■ 4.53
CASKIN1Q8WXD9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
CASKIN1Q8WXD9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CASKIN1Q8WXD9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CASKIN1Q8WXD9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CASKIN1Q8WXD9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CASKIN1Q8WXD9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CASKIN1Q8WXD9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.32■■■■■ 4.52
CASKIN1Q8WXD9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CASKIN1Q8WXD9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CASKIN1Q8WXD9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CASKIN1Q8WXD9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CASKIN1Q8WXD9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
CASKIN1Q8WXD9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CASKIN1Q8WXD9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CASKIN1Q8WXD9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CASKIN1Q8WXD9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CASKIN1Q8WXD9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CASKIN1Q8WXD9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CASKIN1Q8WXD9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CASKIN1Q8WXD9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CASKIN1Q8WXD9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms