Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN6

SECTM1, Secreted and transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECTM1Q8WVN6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SECTM1Q8WVN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SECTM1Q8WVN6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SECTM1Q8WVN6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SECTM1Q8WVN6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SECTM1Q8WVN6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SECTM1Q8WVN6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SECTM1Q8WVN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SECTM1Q8WVN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SECTM1Q8WVN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SECTM1Q8WVN6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SECTM1Q8WVN6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SECTM1Q8WVN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SECTM1Q8WVN6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SECTM1Q8WVN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SECTM1Q8WVN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SECTM1Q8WVN6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SECTM1Q8WVN6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SECTM1Q8WVN6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SECTM1Q8WVN6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SECTM1Q8WVN6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SECTM1Q8WVN6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SECTM1Q8WVN6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SECTM1Q8WVN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SECTM1Q8WVN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SECTM1Q8WVN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SECTM1Q8WVN6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SECTM1Q8WVN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms