Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms