Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ9

BBS1, Bardet-Biedl syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1Q8NFJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS1Q8NFJ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS1Q8NFJ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS1Q8NFJ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS1Q8NFJ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS1Q8NFJ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS1Q8NFJ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS1Q8NFJ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS1Q8NFJ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS1Q8NFJ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS1Q8NFJ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS1Q8NFJ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS1Q8NFJ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS1Q8NFJ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS1Q8NFJ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBS1Q8NFJ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBS1Q8NFJ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS1Q8NFJ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS1Q8NFJ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS1Q8NFJ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS1Q8NFJ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS1Q8NFJ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBS1Q8NFJ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBS1Q8NFJ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS1Q8NFJ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BBS1Q8NFJ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms