Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
USP32Q8NFA0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
USP32Q8NFA0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
USP32Q8NFA0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
USP32Q8NFA0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
USP32Q8NFA0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
USP32Q8NFA0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
USP32Q8NFA0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
USP32Q8NFA0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
USP32Q8NFA0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
USP32Q8NFA0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
USP32Q8NFA0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
USP32Q8NFA0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
USP32Q8NFA0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
USP32Q8NFA0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
USP32Q8NFA0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
USP32Q8NFA0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
USP32Q8NFA0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
USP32Q8NFA0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
USP32Q8NFA0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
USP32Q8NFA0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
USP32Q8NFA0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
USP32Q8NFA0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
USP32Q8NFA0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
USP32Q8NFA0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
USP32Q8NFA0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
USP32Q8NFA0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
USP32Q8NFA0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
USP32Q8NFA0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
USP32Q8NFA0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
USP32Q8NFA0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
USP32Q8NFA0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
USP32Q8NFA0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
USP32Q8NFA0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.91■■■■□ 3.82
USP32Q8NFA0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
USP32Q8NFA0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
USP32Q8NFA0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
USP32Q8NFA0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
USP32Q8NFA0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
USP32Q8NFA0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
USP32Q8NFA0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
USP32Q8NFA0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
USP32Q8NFA0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
USP32Q8NFA0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
USP32Q8NFA0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
USP32Q8NFA0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
USP32Q8NFA0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
USP32Q8NFA0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
USP32Q8NFA0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
USP32Q8NFA0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
USP32Q8NFA0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
USP32Q8NFA0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
USP32Q8NFA0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
USP32Q8NFA0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
USP32Q8NFA0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
USP32Q8NFA0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
USP32Q8NFA0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
USP32Q8NFA0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
USP32Q8NFA0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
USP32Q8NFA0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
USP32Q8NFA0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
USP32Q8NFA0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
USP32Q8NFA0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
USP32Q8NFA0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
USP32Q8NFA0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
USP32Q8NFA0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
USP32Q8NFA0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
USP32Q8NFA0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
USP32Q8NFA0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
USP32Q8NFA0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
USP32Q8NFA0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
USP32Q8NFA0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
USP32Q8NFA0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
USP32Q8NFA0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
USP32Q8NFA0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
USP32Q8NFA0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
USP32Q8NFA0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
USP32Q8NFA0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
USP32Q8NFA0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
USP32Q8NFA0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
USP32Q8NFA0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
USP32Q8NFA0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
USP32Q8NFA0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms