Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST4Q8NCG5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST4Q8NCG5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST4Q8NCG5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHST4Q8NCG5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST4Q8NCG5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST4Q8NCG5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST4Q8NCG5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST4Q8NCG5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHST4Q8NCG5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHST4Q8NCG5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST4Q8NCG5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST4Q8NCG5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST4Q8NCG5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST4Q8NCG5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST4Q8NCG5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST4Q8NCG5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST4Q8NCG5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHST4Q8NCG5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHST4Q8NCG5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST4Q8NCG5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST4Q8NCG5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms