Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA57

C12orf50, Uncharacterized protein C12orf50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf50Q8NA57 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C12orf50Q8NA57 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C12orf50Q8NA57 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C12orf50Q8NA57 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C12orf50Q8NA57 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C12orf50Q8NA57 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C12orf50Q8NA57 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C12orf50Q8NA57 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C12orf50Q8NA57 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C12orf50Q8NA57 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C12orf50Q8NA57 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C12orf50Q8NA57 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C12orf50Q8NA57 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C12orf50Q8NA57 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C12orf50Q8NA57 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C12orf50Q8NA57 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C12orf50Q8NA57 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
C12orf50Q8NA57 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C12orf50Q8NA57 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C12orf50Q8NA57 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C12orf50Q8NA57 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C12orf50Q8NA57 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C12orf50Q8NA57 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C12orf50Q8NA57 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C12orf50Q8NA57 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
C12orf50Q8NA57 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C12orf50Q8NA57 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C12orf50Q8NA57 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C12orf50Q8NA57 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf50Q8NA57 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf50Q8NA57 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf50Q8NA57 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf50Q8NA57 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf50Q8NA57 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf50Q8NA57 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf50Q8NA57 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf50Q8NA57 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf50Q8NA57 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C12orf50Q8NA57 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C12orf50Q8NA57 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C12orf50Q8NA57 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
C12orf50Q8NA57 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C12orf50Q8NA57 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C12orf50Q8NA57 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C12orf50Q8NA57 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms