Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8F6

YIPF7, Protein YIPF7, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF7Q8N8F6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF7Q8N8F6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF7Q8N8F6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF7Q8N8F6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF7Q8N8F6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF7Q8N8F6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF7Q8N8F6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF7Q8N8F6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF7Q8N8F6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF7Q8N8F6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF7Q8N8F6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF7Q8N8F6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF7Q8N8F6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF7Q8N8F6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF7Q8N8F6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF7Q8N8F6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF7Q8N8F6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF7Q8N8F6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF7Q8N8F6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF7Q8N8F6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF7Q8N8F6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF7Q8N8F6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF7Q8N8F6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YIPF7Q8N8F6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YIPF7Q8N8F6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YIPF7Q8N8F6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YIPF7Q8N8F6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YIPF7Q8N8F6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YIPF7Q8N8F6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF7Q8N8F6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
YIPF7Q8N8F6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF7Q8N8F6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF7Q8N8F6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF7Q8N8F6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF7Q8N8F6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms