Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC17Q8N6Y2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC17Q8N6Y2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC17Q8N6Y2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC17Q8N6Y2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC17Q8N6Y2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC17Q8N6Y2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC17Q8N6Y2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC17Q8N6Y2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC17Q8N6Y2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC17Q8N6Y2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC17Q8N6Y2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC17Q8N6Y2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC17Q8N6Y2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC17Q8N6Y2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC17Q8N6Y2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC17Q8N6Y2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC17Q8N6Y2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC17Q8N6Y2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC17Q8N6Y2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC17Q8N6Y2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC17Q8N6Y2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC17Q8N6Y2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC17Q8N6Y2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC17Q8N6Y2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms