Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC155Q8N6L0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC155Q8N6L0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC155Q8N6L0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC155Q8N6L0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC155Q8N6L0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC155Q8N6L0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC155Q8N6L0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC155Q8N6L0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC155Q8N6L0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC155Q8N6L0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC155Q8N6L0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC155Q8N6L0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC155Q8N6L0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC155Q8N6L0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC155Q8N6L0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC155Q8N6L0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC155Q8N6L0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC155Q8N6L0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC155Q8N6L0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC155Q8N6L0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC155Q8N6L0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC155Q8N6L0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC155Q8N6L0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC155Q8N6L0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC155Q8N6L0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC155Q8N6L0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC155Q8N6L0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC155Q8N6L0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC155Q8N6L0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC155Q8N6L0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC155Q8N6L0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC155Q8N6L0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC155Q8N6L0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC155Q8N6L0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC155Q8N6L0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC155Q8N6L0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC155Q8N6L0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC155Q8N6L0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC155Q8N6L0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC155Q8N6L0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC155Q8N6L0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC155Q8N6L0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC155Q8N6L0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC155Q8N6L0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC155Q8N6L0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC155Q8N6L0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC155Q8N6L0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC155Q8N6L0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC155Q8N6L0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC155Q8N6L0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC155Q8N6L0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC155Q8N6L0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms