Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP9Q8IXQ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP9Q8IXQ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP9Q8IXQ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP9Q8IXQ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP9Q8IXQ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP9Q8IXQ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP9Q8IXQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP9Q8IXQ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP9Q8IXQ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP9Q8IXQ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP9Q8IXQ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP9Q8IXQ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP9Q8IXQ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP9Q8IXQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP9Q8IXQ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP9Q8IXQ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP9Q8IXQ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP9Q8IXQ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP9Q8IXQ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PARP9Q8IXQ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP9Q8IXQ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP9Q8IXQ6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PARP9Q8IXQ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP9Q8IXQ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP9Q8IXQ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP9Q8IXQ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP9Q8IXQ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP9Q8IXQ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP9Q8IXQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP9Q8IXQ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP9Q8IXQ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP9Q8IXQ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP9Q8IXQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP9Q8IXQ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP9Q8IXQ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP9Q8IXQ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARP9Q8IXQ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP9Q8IXQ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP9Q8IXQ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP9Q8IXQ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP9Q8IXQ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP9Q8IXQ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms