Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACUL1Q86Y37 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACUL1Q86Y37 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACUL1Q86Y37 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACUL1Q86Y37 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACUL1Q86Y37 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACUL1Q86Y37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACUL1Q86Y37 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACUL1Q86Y37 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACUL1Q86Y37 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACUL1Q86Y37 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACUL1Q86Y37 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACUL1Q86Y37 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACUL1Q86Y37 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACUL1Q86Y37 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms