Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y25

ZNF354C, Zinc finger protein 354C, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354CQ86Y25 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF354CQ86Y25 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF354CQ86Y25 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF354CQ86Y25 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF354CQ86Y25 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF354CQ86Y25 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF354CQ86Y25 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF354CQ86Y25 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF354CQ86Y25 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF354CQ86Y25 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF354CQ86Y25 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF354CQ86Y25 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF354CQ86Y25 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF354CQ86Y25 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF354CQ86Y25 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF354CQ86Y25 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF354CQ86Y25 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF354CQ86Y25 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF354CQ86Y25 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF354CQ86Y25 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF354CQ86Y25 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF354CQ86Y25 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF354CQ86Y25 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF354CQ86Y25 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF354CQ86Y25 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF354CQ86Y25 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.5 ms