Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHSY1Q86X52 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHSY1Q86X52 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHSY1Q86X52 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHSY1Q86X52 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHSY1Q86X52 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHSY1Q86X52 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHSY1Q86X52 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHSY1Q86X52 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHSY1Q86X52 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHSY1Q86X52 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHSY1Q86X52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHSY1Q86X52 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHSY1Q86X52 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHSY1Q86X52 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHSY1Q86X52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHSY1Q86X52 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHSY1Q86X52 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHSY1Q86X52 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHSY1Q86X52 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHSY1Q86X52 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHSY1Q86X52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHSY1Q86X52 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHSY1Q86X52 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHSY1Q86X52 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHSY1Q86X52 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHSY1Q86X52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHSY1Q86X52 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHSY1Q86X52 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHSY1Q86X52 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHSY1Q86X52 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHSY1Q86X52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHSY1Q86X52 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHSY1Q86X52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHSY1Q86X52 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHSY1Q86X52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHSY1Q86X52 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHSY1Q86X52 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHSY1Q86X52 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHSY1Q86X52 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHSY1Q86X52 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHSY1Q86X52 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms