Protein–RNA interactions for Protein: Q86VY9

TMEM200A, Transmembrane protein 200A, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200AQ86VY9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM200AQ86VY9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM200AQ86VY9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM200AQ86VY9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM200AQ86VY9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM200AQ86VY9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM200AQ86VY9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM200AQ86VY9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM200AQ86VY9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM200AQ86VY9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM200AQ86VY9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM200AQ86VY9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM200AQ86VY9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM200AQ86VY9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM200AQ86VY9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM200AQ86VY9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms