Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALYREFQ86V81 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALYREFQ86V81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALYREFQ86V81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ALYREFQ86V81 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALYREFQ86V81 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALYREFQ86V81 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALYREFQ86V81 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALYREFQ86V81 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALYREFQ86V81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALYREFQ86V81 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ALYREFQ86V81 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALYREFQ86V81 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALYREFQ86V81 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALYREFQ86V81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALYREFQ86V81 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms