Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN4Q86UW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HAPLN4Q86UW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAPLN4Q86UW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN4Q86UW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HAPLN4Q86UW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN4Q86UW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN4Q86UW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN4Q86UW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN4Q86UW8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN4Q86UW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN4Q86UW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAPLN4Q86UW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HAPLN4Q86UW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAPLN4Q86UW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAPLN4Q86UW8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms