Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
PBRM1Q86U86 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
PBRM1Q86U86 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC47.29■■■■■ 5.16
PBRM1Q86U86 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
PBRM1Q86U86 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
PBRM1Q86U86 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
PBRM1Q86U86 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
PBRM1Q86U86 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
PBRM1Q86U86 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
PBRM1Q86U86 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
PBRM1Q86U86 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
PBRM1Q86U86 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.18■■■■■ 5.14
PBRM1Q86U86 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
PBRM1Q86U86 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC47.16■■■■■ 5.14
PBRM1Q86U86 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
PBRM1Q86U86 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
PBRM1Q86U86 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
PBRM1Q86U86 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
PBRM1Q86U86 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
PBRM1Q86U86 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
PBRM1Q86U86 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
PBRM1Q86U86 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
PBRM1Q86U86 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.06■■■■■ 5.12
PBRM1Q86U86 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
PBRM1Q86U86 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC47.04■■■■■ 5.12
PBRM1Q86U86 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
PBRM1Q86U86 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
PBRM1Q86U86 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
PBRM1Q86U86 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
PBRM1Q86U86 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
PBRM1Q86U86 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
PBRM1Q86U86 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
PBRM1Q86U86 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
PBRM1Q86U86 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
PBRM1Q86U86 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.84■■■■■ 5.09
PBRM1Q86U86 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
PBRM1Q86U86 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
PBRM1Q86U86 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
PBRM1Q86U86 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
PBRM1Q86U86 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
PBRM1Q86U86 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
PBRM1Q86U86 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
PBRM1Q86U86 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.72■■■■■ 5.07
PBRM1Q86U86 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
PBRM1Q86U86 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
PBRM1Q86U86 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
PBRM1Q86U86 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
PBRM1Q86U86 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC46.7■■■■■ 5.07
PBRM1Q86U86 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
PBRM1Q86U86 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
PBRM1Q86U86 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
PBRM1Q86U86 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
PBRM1Q86U86 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
PBRM1Q86U86 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
PBRM1Q86U86 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
PBRM1Q86U86 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
PBRM1Q86U86 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
PBRM1Q86U86 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
PBRM1Q86U86 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
PBRM1Q86U86 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC46.54■■■■■ 5.04
PBRM1Q86U86 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
PBRM1Q86U86 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
PBRM1Q86U86 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
PBRM1Q86U86 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
PBRM1Q86U86 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
PBRM1Q86U86 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
PBRM1Q86U86 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
PBRM1Q86U86 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
PBRM1Q86U86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
PBRM1Q86U86 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
PBRM1Q86U86 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
PBRM1Q86U86 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
PBRM1Q86U86 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
PBRM1Q86U86 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
PBRM1Q86U86 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
PBRM1Q86U86 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
PBRM1Q86U86 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
PBRM1Q86U86 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.2■■■■■ 4.99
PBRM1Q86U86 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
PBRM1Q86U86 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
PBRM1Q86U86 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
PBRM1Q86U86 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
PBRM1Q86U86 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
PBRM1Q86U86 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
PBRM1Q86U86 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
PBRM1Q86U86 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
PBRM1Q86U86 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.13■■■■■ 4.97
PBRM1Q86U86 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC46.11■■■■■ 4.97
PBRM1Q86U86 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
PBRM1Q86U86 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
PBRM1Q86U86 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
PBRM1Q86U86 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms