Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM29Q86T20 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM29Q86T20 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM29Q86T20 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM29Q86T20 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM29Q86T20 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM29Q86T20 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms